污迹和细菌分别是可见和不可见的污染物，对于污迹多数湿巾都能去除，而对于细菌则需要湿巾中添加了杀菌成分。目前市场上的湿巾能分成两类：一类本身被消毒，但未添加杀菌成分，因而仅能擦去物品表面污迹，而不能起到杀菌消毒的作用;另一类添加了杀菌成分，包装上会有所提到，常用的有苯扎氯铵、十六烷基氯化吡啶、西吡氯铵等，可以在皮肤擦伤、划伤等情况下用作消毒或杀菌，适合外出时使用。有些媒体对于湿巾中杀菌成分有毒且危害健康的说法实属夸大，杀菌成分在高浓度下确实可能具有毒性和刺激性，但在湿巾中非常微量，构不成伤害，只要家长们注意勿让宝宝咀嚼湿巾，并且勿用湿巾擦拭入口器皿即可。
人体用湿巾有微生物指标规定。普通级的湿巾规定是细菌菌落总数每克湿巾中不可以超出200个，真菌数量不超出100个，而且不可验出大肠菌群、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、溶血性链球菌等致病微生物。而卫生湿巾规定更高，细菌菌落总数每克湿巾中不可以超出20个，除开和普通级湿巾一样不可以有这些致病菌，真菌也不可验出。
湿巾保湿作用，丙二醇是湿巾中比较常用的保湿滋润成分，此外芦荟精华也有一定的保湿性，虽然有些湿巾的成分看起来很天然安全，但如果不具备保湿剂，其有效性也会大打折扣。
